摘要

目的 基于网络药理学探讨山慈菇治疗骨肉瘤的药效分子与药效机制，并采用分子对接模拟技术验证其潜在药效靶点。方法 选择TCMSP数据库和HERB数据库预测山慈菇的活性成分及相关靶点；GEO数据库筛选骨肉瘤差异表达基因；取骨肉瘤差异表达基因与山慈菇预测靶点的交集获得交集基因，Cytoscape 3.8.1软件构建山慈菇活性成分-骨肉瘤靶点的关联网络；交集基因导入STRING数据库构建PPI网络，Cytoscape 3.8.1软件拓扑分析筛选出山慈菇治疗骨肉瘤的核心靶点；基于R语言的Bioconductor软件合集对交集基因进行基因本体（GO）和京都基因和基因组百科全书（KEGG）富集分析；应用Auto Dock 1.5.6和Vina进行分子对接模拟活性成分与核心靶点的结合强度。结果 从TCMSP与HERB数据库筛选出山慈菇预测22个及其对应的靶点96个；从3个骨肉瘤芯片（GSE36001、GSE28424、GSE19276）中筛选出3 178个骨肉瘤差异表达基因；活性成分的96个调控靶点和3 178个骨肉瘤差异表达基因映射获得预测靶点43个。PPI拓扑分析获得4个核心靶点，即PTGS2、SRC、ESR1、CASP3;GO富集分析获得结果 1 518条，其中BP结果 1 419条，CC结果 13条，MF结果 85条；KEGG富集分析获得信号通路133条，主要涉及细胞凋亡、肿瘤坏死因子和P53等信号通路。分子对接模拟验证4个核心靶点和对应的9个山慈菇活性成分结合能力，获得结合能<-5 kcal/mol的对接结果 11对。结论 从分子水平揭示了山慈菇治疗骨肉瘤具有多成分、多靶点和多向药理学特征，为山慈菇治疗骨肉瘤的药效成分和靶点研究提供依据。

关键词