摘要

目的 筛选胃腺癌(Gastric adenocarcinoma, GAC)差异表达的关键基因并进行验证，分析其调控通路。方法 自美国国立生物技术信息中心基因表达数据库(Gene expression omnibus, GEO)下载GAC基因芯片数据集GSE118916。应用R语言Limma程序包筛选GAC与癌旁对照组织差异表达基因(Differentially expressed genes, DEGs)。应用R语言ClusterProfiler程序包对GAC的DEGs进行京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, KEGG)通路分析。通过DAVID(Database for Annotation, Visualization and Integrated Discovery)数据库对GAC的DEGs进行基因本体(GO)功能富集分析。使用STRING(Search Tool for the Retrieval of Interacting Genes)和Cytoscape构建蛋白质间相互作用网络(PPI),筛选其核心模块和关键基因。使用UALCAN数据库分析关键基因与GAC患者预后的关系。GEPIA数据库分析预后关键基因与GAC患者TNM的相关性。采用单基因GSEA分析关键基因调控的通路。结果 GAC癌组织和癌旁组织存在704个DEGs,其中上调基因422个，下调基因282个。GO功能富集结果显示，DEGs主要富集在细胞外基质组织、细胞粘附、炎症反应、胶原蛋白分解代谢等功能通路；KEGG通路分析显示，DEGs主要影响ECM-受体相互作用、黏着斑、补体通路等多条通路。在PPI网络筛选的关键基因中，C3、GNB4和COL1A2影响GAC患者预后和GAC进展。单基因GSEA结果显示，C3、GNB4和COL1A2可能通过黏着斑、癌症通路、干细胞Wnt信号、转化生长因子-β信号途径影响GAC患者的预后。结论 C3、GNB4和COL1A2是影响GAC进展和预后的关键基因，其调控通路可能与黏着斑、癌症通路相关。

关键词