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ISSN 1008-5971CN 13-1258/R
实用心脑肺血管病杂志

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河北省医学情报研究所主办

当前位置:首页过刊浏览2023年 / 31卷 / 01期基于网络药理学与分子对接技术探讨绞股蓝-虎杖治疗亚临床动脉粥样硬化的潜在分子机制

基于网络药理学与分子对接技术探讨绞股蓝-虎杖治疗亚临床动脉粥样硬化的潜在分子机制

李佳[1,2]
何俊[1]
刘福明[2]

[1] 江苏省常州市德安医院康复中心

[2] 南京中医药大学附属医院江苏省中医院心血管内科

实用心脑肺血管病杂志 2023年 / 31卷 / 01期68-76
3 次引用

摘要

目的 基于网络药理学与分子对接技术探讨绞股蓝-虎杖治疗亚临床动脉粥样硬化(Sub-AS)的潜在分子机制。方法 通过中药系统药理学数据库和分析平台筛选绞股蓝、虎杖的活性成分及靶点,通过Genecards、OMIM数据库筛选Sub-AS相关靶点,通过Venny在线平台获取绞股蓝-虎杖治疗Sub-AS的潜在靶点,通过STRING 11.5构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络并进行拓扑分析以筛选绞股蓝-虎杖治疗Sub-AS的关键靶点;之后针对绞股蓝-虎杖治疗Sub-AS的关键靶点进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,构建药物活性成分-疾病靶点-通路网络;最后通过Auto Dock vina V1.2.0和Py Mol对筛选出的绞股蓝-虎杖核心活性成分与核心疾病靶点进行分子对接。结果 本研究共得到绞股蓝、虎杖活性成分24种,靶点208个;Sub-AS相关靶点1 321个。最终得到97个绞股蓝-虎杖治疗Sub-AS的潜在靶点。构建PPI网络并进行拓扑分析,结果显示,肿瘤坏死因子(TNF)、白介素(IL)6、IL4、IL10、IL1B、血管内皮生长因子(VEGF)A、基质金属蛋白酶(MMP)9、CXCL8、CCL2、细胞间黏附分子(ICAM)1、RELA是绞股蓝-虎杖治疗SubAS的关键靶点。GO功能富集分析结果显示,细胞组成条目91个,主要包括膜筏、受体复合体、外侧细胞膜、细胞外基质等;分子功能条目128个,主要包括信号受体调节活动、氧化还原反应等;生物过程条目253个,主要包括正调控细胞运动、调控细胞附着、负调控细胞分化等。KEGG通路富集分析结果显示,绞股蓝-虎杖治疗Sub-AS的关键靶点主要参与的通路是TNF信号通路、IL-17信号通路等。药物活性成分-疾病靶点-通路网络显示,度值最高的药物活性成分是槲皮素,其次为木犀草素、β-谷甾醇;度值最高的疾病靶点是HSP90AB1,其次是PTGS2、RELA、TNF、IL6、IL1B、ICAM1;富集的通路主要包括IL-17信号通路和癌症通路,其次是脂质和动脉硬化、流体剪切应力与动脉粥样硬化。分子对接结果显示,槲皮素-TNF、槲皮素-PTGS2、木犀草素-PTGS2、木犀草素-ICAM1、木犀草素-HSP90AB1的对接模式较好。结论绞股蓝-虎杖抗Sub-AS的主要活性成分有槲皮素、木犀草素、β-谷甾醇等,其可作用于TNF、IL6等多个靶点,通过调控IL-17信号通路、TNF信号通路等发挥作用。

关键词

动脉粥样硬化亚临床动脉粥样硬化绞股蓝虎杖网络药理学分子对接技术

参考文献

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