摘要

目的 筛选并鉴定COVID-19与动脉粥样硬化(AS)不稳定斑块的共同疾病基因。方法 从基因表达综合(GEO)数据库下载GSE164805、GSE28829、GSE41571、GSE163154数据集，然后将GSE28829、GSE41571数据集作为AS训练集，GSE163154数据集作为AS验证集。筛选GSE164805数据集中COVID-19和健康对照者(HC)间的差异表达基因(DEGs)及AS训练集中AS不稳定斑块和AS稳定斑块间的DEGs。绘制COVID-19和HC间的DEGs与AS不稳定斑块和AS稳定斑块间的DEGs的韦恩图，筛选COVID-19与AS不稳定斑块的共同DEGs。将共同DEGs导入String数据库进行蛋白质-蛋白质互作(PPI)网络分析，以最大相关准则(MCC)值排序前10位的基因作为共同核心DEGs。在GSE164805数据集和AS训练集中分析10个共同核心DEGs的表达水平。绘制ROC曲线以分析10个共同核心DEGs对AS验证集AS不稳定斑块的预测效能。结果 在GSE164805数据集中，COVID-19和HC间的DEGs共5 379个。在AS训练集中，AS不稳定斑块和AS稳定斑块间的DEGs共1 615个。韦恩图分析结果显示，COVID-19与AS不稳定斑块的共同DEGs共210个。PPI网络分析结果显示，取MCC排序前10位的基因作为共同核心DEGs，分别为TLR2、FCGR3B、TLR8、CSF1R、MMP9、TLR1、CD163、SPI1、CD80、C5AR1。在GSE164805数据集中，COVID-19的TLR2、FCGR3B、TLR8、CSF1R、MMP9、TLR1、CD163、SPI1、CD80、C5AR1表达水平高于HC(P<0.05)；在AS训练集中，AS不稳定斑块的TLR2、FCGR3B、TLR8、CSF1R、MMP9、TLR1、CD163、SPI1、CD80、C5AR1表达水平高于AS稳定斑块(P<0.05)。ROC曲线分析结果显示，TLR2、FCGR3B、TLR8、CSF1R、MMP9、TLR1、CD163、SPI1、CD80、C5AR1预测AS验证集AS不稳定斑块的AUC分别为0.873〔95%CI(0.746～0.999)〕、0.565〔95%CI(0.385～0.746)〕、0.843〔95%CI(0.691～0.994)〕、0.953〔95%CI(0.898～1.000)〕、0.938〔95%CI(0.861～1.000)〕、0.831〔95%CI(0.694～0.968)〕、0.951〔95%CI(0.895～1.000)〕、0.981〔95%CI(0.931～1.000)〕、0.935〔95%CI(0.856～1.000)〕、0.984〔95%CI(0.958～1.000)〕。结论 TLR2、TLR8、CSF1R、MMP9、TLR1、CD163、SPI1、CD80、C5AR1可能是COVID-19与AS不稳定斑块的共同疾病基因。

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